Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPX2O60687 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms