Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSL4O60488 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL4O60488 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms