Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD5O60279 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD5O60279 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD5O60279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD5O60279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD5O60279 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD5O60279 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD5O60279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD5O60279 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD5O60279 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD5O60279 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD5O60279 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD5O60279 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUSD5O60279 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD5O60279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD5O60279 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD5O60279 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD5O60279 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD5O60279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD5O60279 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD5O60279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD5O60279 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD5O60279 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms