Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1O43719 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HTATSF1O43719 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1O43719 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
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