Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COCHO43405 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COCHO43405 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COCHO43405 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COCHO43405 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COCHO43405 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COCHO43405 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COCHO43405 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COCHO43405 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COCHO43405 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COCHO43405 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COCHO43405 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COCHO43405 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COCHO43405 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COCHO43405 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COCHO43405 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COCHO43405 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COCHO43405 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COCHO43405 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COCHO43405 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms