Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTIFO43310 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTIFO43310 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTIFO43310 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTIFO43310 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTIFO43310 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTIFO43310 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTIFO43310 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTIFO43310 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTIFO43310 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTIFO43310 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTIFO43310 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTIFO43310 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTIFO43310 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTIFO43310 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTIFO43310 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTIFO43310 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTIFO43310 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTIFO43310 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTIFO43310 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTIFO43310 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTIFO43310 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTIFO43310 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTIFO43310 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTIFO43310 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTIFO43310 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTIFO43310 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTIFO43310 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTIFO43310 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTIFO43310 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTIFO43310 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTIFO43310 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTIFO43310 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTIFO43310 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTIFO43310 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTIFO43310 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTIFO43310 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTIFO43310 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTIFO43310 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTIFO43310 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTIFO43310 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTIFO43310 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTIFO43310 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTIFO43310 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTIFO43310 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTIFO43310 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTIFO43310 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTIFO43310 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTIFO43310 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTIFO43310 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTIFO43310 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTIFO43310 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTIFO43310 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTIFO43310 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTIFO43310 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTIFO43310 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTIFO43310 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTIFO43310 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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