Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 MGST1-214ENST00000539708 700 ntTSL 23.7□□□□□ -1.825e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.885e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.15e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-209ENST00000536371 298 ntTSL 51.85□□□□□ -2.115e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.155e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-210ENST00000537878 551 ntTSL 21.43□□□□□ -2.185e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 HERPUD1-209ENST00000564678 2199 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 512.02□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 PACSIN2-207ENST00000422336 664 ntTSL 59.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 58.1□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 ATF7IP2-209ENST00000562396 1681 nt18.19■□□□□ 0.52e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-216ENST00000569900 559 ntTSL 412.72□□□□□ -0.372e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 411.5□□□□□ -0.572e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-210ENST00000562527 625 ntTSL 38.2□□□□□ -1.12e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-205ENST00000535850 1907 ntTSL 28.17□□□□□ -1.12e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.492e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-217ENST00000569939 564 ntTSL 45.46□□□□□ -1.542e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 33.5□□□□□ -1.852e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 43.11□□□□□ -1.912e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.992e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-218ENST00000570163 559 ntTSL 21.15□□□□□ -2.232e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 ATF7IP2-214ENST00000566316 576 ntTSL 20.54□□□□□ -2.322e-21■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 DLGAP4-207ENST00000477195 490 ntTSL 58.75□□□□□ -1.013e-15■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 DLGAP4-216ENST00000497862 467 ntTSL 56.01□□□□□ -1.453e-15■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.037e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-216ENST00000641856 2619 nt14.46□□□□□ -0.097e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.447e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-208ENST00000585320 503 ntTSL 311.38□□□□□ -0.597e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-215ENST00000641709 3232 nt11.31□□□□□ -0.67e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-203ENST00000582171 1372 ntTSL 211.26□□□□□ -0.617e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-212ENST00000641427 1411 nt11.21□□□□□ -0.617e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.727e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-210ENST00000641305 3315 nt10.5□□□□□ -0.737e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-211ENST00000641323 3657 nt10.15□□□□□ -0.787e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-214ENST00000641703 1131 nt9.41□□□□□ -0.97e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-206ENST00000584061 723 ntTSL 48.05□□□□□ -1.127e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-204ENST00000583245 518 ntTSL 57.64□□□□□ -1.197e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-209ENST00000641285 488 nt7.11□□□□□ -1.277e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-205ENST00000583599 696 ntTSL 46.94□□□□□ -1.37e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PNPO-213ENST00000641511 453 nt6.09□□□□□ -1.437e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PTPRA-208ENST00000455631 1107 ntTSL 516.84■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PTPRA-207ENST00000431048 707 ntTSL 516.13■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PTPRA-206ENST00000430705 733 ntTSL 512.24□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.296e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 SLC22A5-204ENST00000437841 850 ntTSL 511.13□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 SLC22A5-202ENST00000415928 720 ntTSL 59.58□□□□□ -0.886e-9■■■■■ 34.2
RBFOX2O43251 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.566e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 NAALADL1-216ENST00000532432 464 ntTSL 418.45■□□□□ 0.546e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 GSDMD-216ENST00000534602 480 ntTSL 216.36■□□□□ 0.217e-19■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.146e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.16e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.426e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.436e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.856e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.896e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 ANKMY1-223ENST00000489677 292 ntTSL 56.02□□□□□ -1.456e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 MAGED2-210ENST00000487463 376 ntTSL 25.74□□□□□ -1.496e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 SAMD5-202ENST00000566741 393 ntTSL 33.87□□□□□ -1.796e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.946e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 AL033504.1-202ENST00000432506 406 ntTSL 22.59□□□□□ -1.996e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 AL033504.1-203ENST00000442094 404 ntTSL 30.88□□□□□ -2.276e-10■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.396e-12■■■■■ 34.1
RBFOX2O43251 CPNE7-209ENST00000568977 682 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-14■■■■■ 34
RBFOX2O43251 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.187e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.097e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.037e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 WDR25-205ENST00000554492 510 ntTSL 413.88□□□□□ -0.197e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.367e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 GRK6-210ENST00000515666 2141 ntTSL 512.68□□□□□ -0.387e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.397e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.477e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 WDR25-208ENST00000555775 705 ntTSL 512.01□□□□□ -0.497e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 WDR25-211ENST00000557710 1751 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 FURIN-203ENST00000559353 587 ntTSL 311.78□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.577e-10■■■■■ 34
RBFOX2O43251 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.77e-10■■■■■ 34
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