Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSC2O15499 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSC2O15499 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSC2O15499 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSC2O15499 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSC2O15499 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSC2O15499 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSC2O15499 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSC2O15499 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GSC2O15499 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSC2O15499 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSC2O15499 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSC2O15499 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSC2O15499 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSC2O15499 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSC2O15499 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSC2O15499 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSC2O15499 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSC2O15499 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSC2O15499 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSC2O15499 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSC2O15499 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSC2O15499 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSC2O15499 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSC2O15499 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSC2O15499 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSC2O15499 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSC2O15499 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms