Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTLC1O15269 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTLC1O15269 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTLC1O15269 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms