Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA5O15230 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA5O15230 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA5O15230 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms