Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCYO14598 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VCYO14598 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VCYO14598 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCYO14598 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCYO14598 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCYO14598 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCYO14598 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VCYO14598 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCYO14598 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VCYO14598 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VCYO14598 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VCYO14598 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VCYO14598 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VCYO14598 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms