Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTDSP2O14595 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSP2O14595 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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