Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWA5AO00534 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VWA5AO00534 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VWA5AO00534 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA5AO00534 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA5AO00534 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA5AO00534 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms