Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF3FO00303 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3FO00303 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms