Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3B1O00203 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3B1O00203 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms