Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8VRH5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8VRH5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F8VRH5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
F8VRH5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
F8VRH5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F8VRH5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F8VRH5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F8VRH5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
F8VRH5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
F8VRH5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
F8VRH5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
F8VRH5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
F8VRH5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
F8VRH5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
F8VRH5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F8VRH5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8VRH5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms