Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B2RBV5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B2RBV5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B2RBV5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B2RBV5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B2RBV5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B2RBV5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B2RBV5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B2RBV5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B2RBV5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B2RBV5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B2RBV5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B2RBV5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B2RBV5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B2RBV5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B2RBV5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B2RBV5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B2RBV5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B2RBV5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B2RBV5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B2RBV5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B2RBV5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B2RBV5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B2RBV5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B2RBV5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B2RBV5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B2RBV5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B2RBV5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B2RBV5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B2RBV5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B2RBV5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B2RBV5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B2RBV5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B2RBV5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B2RBV5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B2RBV5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B2RBV5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms