Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTLL13PA6NNM8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTLL13PA6NNM8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL13PA6NNM8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms