Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8L1PA6NM43 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms