Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XIRP2A4UGR9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XIRP2A4UGR9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms