Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCRBV5S2A0A599 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCRBV5S2A0A599 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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