Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms