Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms