Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms