Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms