Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRBP1Q9P2E9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms