Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD93Q9NPY3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms