Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms