Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms