Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRACR2AQ9BSW2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRACR2AQ9BSW2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms