Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms