Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHOXF2Q9BQY4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms