Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms