Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGIP1Q9BQI5 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms