Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF12Q99081 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms