Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms