Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms