Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP31Q70CQ4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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