Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SAMD13Q5VXD3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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