Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms