Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms