Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC93Q567U6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms