Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.4 ms