Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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