Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DDB1Q16531 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms