Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB35Q15286 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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