Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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