Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EEA1Q15075 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
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