Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL19A1Q14993 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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