Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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